Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm20877J3QPZ4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm20877J3QPZ4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm20877J3QPZ4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm20877J3QPZ4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm20877J3QPZ4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm20877J3QPZ4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20877J3QPZ4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms