Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm21818J3KMS6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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