Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syde2E9PUP1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms