Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uhrf1bp1B2KF50 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms