Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms