Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
OtofQ9ESF1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
OtofQ9ESF1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
OtofQ9ESF1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
OtofQ9ESF1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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