Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Pop5Q9DB28 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pop5Q9DB28 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms