Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn22Q9D7U6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms