Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Pfn4Q9D6I3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pfn4Q9D6I3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pfn4Q9D6I3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pfn4Q9D6I3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Pfn4Q9D6I3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Pfn4Q9D6I3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Pfn4Q9D6I3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Pfn4Q9D6I3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Pfn4Q9D6I3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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