Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Tmed6Q9CQG0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Tmed6Q9CQG0 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Tmed6Q9CQG0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Tmed6Q9CQG0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Tmed6Q9CQG0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmed6Q9CQG0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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