Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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