Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLNK-204ENST00000427367 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01468-202ENST00000435813 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002495.1-202ENST00000528511 933 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR4K14-202ENST00000641793 1245 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02006-202ENST00000492569 1958 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP9-3Q9BYQ3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms