Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NanogQ80Z64 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms