Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LnpkQ7TQ95 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms