Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clcn1Q64347 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms