Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lama3Q61789 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lama3Q61789 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lama3Q61789 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lama3Q61789 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lama3Q61789 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lama3Q61789 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lama3Q61789 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lama3Q61789 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lama3Q61789 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lama3Q61789 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms