Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q3U1D9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q3U1D9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q3U1D9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q3U1D9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q3U1D9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q3U1D9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q3U1D9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Q3U1D9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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