Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim71Q1PSW8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms