Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sox12Q04890 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms