Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
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