Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Apoc1P34928 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms