Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PdgfraP26618 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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PdgfraP26618 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PdgfraP26618 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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