Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gja1P23242 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gja1P23242 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gja1P23242 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gja1P23242 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gja1P23242 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms