Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prim1P20664 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Prim1P20664 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prim1P20664 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms