Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FxnO35943 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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FxnO35943 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FxnO35943 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FxnO35943 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FxnO35943 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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FxnO35943 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
FxnO35943 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
FxnO35943 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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FxnO35943 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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