Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.8 ms