Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf518bB2RRE4 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf518bB2RRE4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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