Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip6Q9Z1Y4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms