Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cpsf3Q9QXK7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cpsf3Q9QXK7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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