Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Crlf1Q9JM58 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms