Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gde1Q9JL56 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gde1Q9JL56 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms