Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Jam3Q9D8B7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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Jam3Q9D8B7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Jam3Q9D8B7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms