Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop56Q9D6Z1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Nop56Q9D6Z1 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nop56Q9D6Z1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Nop56Q9D6Z1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Nop56Q9D6Z1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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