Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1lQ9D1E5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1lQ9D1E5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms