Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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Znf628Q8CJ78 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Znf628Q8CJ78 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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