Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psmd1Q3TXS7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmd1Q3TXS7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms