Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp5P56399 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp5P56399 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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