Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Mmp9P41245 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Mmp9P41245 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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