Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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P18526 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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P18526 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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P18526 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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P18526 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18526 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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P18526 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P18526 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P18526 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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P18526 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P18526 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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