Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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