Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrgnP13609 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrgnP13609 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrgnP13609 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms