Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PtprqP0C5E4 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PtprqP0C5E4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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PtprqP0C5E4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
PtprqP0C5E4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
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