Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MsmbO08540 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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