Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5478D3Z6R0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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