Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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