Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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