Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Dnajb11Q99KV1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dnajb11Q99KV1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dnajb11Q99KV1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dnajb11Q99KV1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dnajb11Q99KV1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dnajb11Q99KV1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Dnajb11Q99KV1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Dnajb11Q99KV1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Dnajb11Q99KV1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Dnajb11Q99KV1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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