Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ppargc1bQ8VHJ7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ppargc1bQ8VHJ7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms