Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trip10Q8CJ53 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trip10Q8CJ53 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trip10Q8CJ53 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trip10Q8CJ53 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms