Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbsnQ8CIT9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms